C’est un fait. À l’aune des évolutions technologiques des dernières années, au premier rang desquelles l’automatisation de leurs chaînes de microbiologie, les laboratoires génèrent de plus en plus de données biologiques brutes. Autant de data qui, une fois traitées et modélisées, représentent un formidable potentiel pour accompagner les prises de décision des services de biologie et des cliniciens, au service d’une médecine plus précise et plus efficace. 

Souhaitant faire bénéficier à ses patients de ces avancées et afin de tirer le meilleur parti des plus de 1500 résultats – mécanismes de résistance, identifications bactériennes, PCR –, traités quotidiennement par son laboratoire, le CH de Valenciennes (CHV), s’est donc tourné vers la solution MAESTRIA™. Car le middleware nouvelle génération de bioMérieux, conçu par des microbiologistes pour des microbiologistes, ne se contente pas d’améliorer les flux de travail du laboratoire grâce au pilotage centralisé des automates, ni d’identifier rapidement le niveau de résistance d’une espèce bactérienne à un ou plusieurs antibiotiques au travers de son module d’antibiogramme cumulatif. Il promet également de consolider en temps réel les données issues de ces outils et des saisies manuelles, pour les valoriser au travers de statistiques dynamiques et d’indicateurs de pilotage générés automatiquement et facilement personnalisables.

Pour objectiver ce potentiel, les équipes de l’hôpital valenciennois se sont donc lancées dans une étude comparative visant à évaluer la performance de ce nouveau logiciel et les bénéfices apportés par rapport à leur ancien système, en s’intéressant plus particulièrement à l’axe hémoculture - épidémiologie bactérienne. Le tout, au travers de quatre indicateurs de qualité particulièrement importants pour le laboratoire, à savoir le taux de positivité des hémocultures, le volume de remplissage des flacons, le taux de contamination, et le taux de résistance à l’association Piperacilline-Tazobactam et C3G. « L’étude a montré que MAESTRIA™ est plus rapide et permet plus d’autonomie en évitant le recours à un personnel informatique dédié. N’importe quel biologiste du laboratoire peut désormais générer des indicateurs de performance de manière simple et intuitive », rapporte le Dr Tristan Diedrich, lui-même biologiste au sein du service de microbiologie de l’hôpital et utilisateur du système.

En compilant les données issues de l’automate VIRTUO®, MAESTRIA™ propose par exemple de suivre les taux de remplissage ou de contamination des flacons et, grâce à son interface graphique innovante, de les affiner très simplement par établissement, par service ou par période. « Ce suivi permet notamment de repérer les services principaux “générateurs“ de contaminations et ainsi de resensibiliser les équipes aux bonnes pratiques de prélèvement, poursuit le microbiologiste, avec à la clé une baisse du taux de contamination aux incidences bénéfiques pour tous. Cela représente en effet un gain de temps à la fois pour le service qui ne prélève pas d’hémoculture supplémentaire, mais aussi pour le laboratoire qui ne génère pas d’antibiogrammes ou d’appels aux services inutilement ».

« Les enjeux sur le pré-analytique sont capitaux pour la qualité de la prise en soin des patients et des analyses rendues par le laboratoire, ajoute le Dr Dewulf. Il est donc nécessaire de pouvoir objectiver les pratiques des soignants en termes de qualité de prélèvement, mais aussi les délais de transport et de chargement des flacons, ou de prise en charge des positifs ».

Un avis partagé jusque dans les étages de l’hôpital, qui commencent eux aussi, à l’instar du service de réanimation, à tirer parti de l’accès à ces nouvelles données. « Certains indicateurs, comme le taux de contamination des hémocultures, sont très importants pour nous, témoigne ainsi Céline Cafede, cadre de santé en réanimation. Associés à un audit des pratiques, ils nous permettent, sur le terrain, de retravailler toutes les phases pré-analytiques, comme la désinfection du flacon ou l’antisepsie de la peau. De même, le fait de disposer de données régulières concernant le taux de remplissage des flacons me permet d’alerter les professionnels et d’atteindre nos objectifs de 8 à 10 mL ». Un volume que l’on sait nécessaire à la recherche d’une endocardite ou d’une bactériémie, et un moyen donc, d’assurer un meilleur confort pour le patient, en évitant d’éventuels prélèvements sanguins supplémentaires, induits par l’insuffisance de précédents remplissages.

MAESTRIA™ occupe désormais une place centrale dans l’architecture informatique du laboratoire de microbiologie du CHV, et grâce à sa simplicité d’utilisation, l’intégration avec le SIL préexistant s’est faite de façon naturelle. Autre avantage, il répond parfaitement aux objectifs de la nouvelle feuille de route interministérielle 2024-2034, qui encourage notamment le recours aux outils numériques pour lutter contre la « pandémie silencieuse » que représente l’antibiorésistance. De quoi encourager le laboratoire de Valenciennes de poursuivre dans cette voie. « La prochaine étape, à moyen terme, est de pouvoir connecter l’ensemble des instruments, bioMérieux ou non, à MAESTRIA™, afin de disposer d’une solution unique, qui permette de pousser encore un peu plus loin la gestion de la data », conclut le Dr Dewulf.

Le laboratoire du CHV

Doté de technologies de pointe en matière d’automatisation, de robotisation, d’imagerie, mais aussi d’intelligence artificielle, et premier centre d’excellence bioMérieux à avoir vu le jour en Europe, le centre hospitalier de Valenciennes bénéficie du statut de laboratoire de référence pour la prise en charge des pathologies infectieuses des établissements de santé du GHT et d’une partie de l’Artois, soit six hôpitaux, 4 cliniques, et une patientèle de ville.

Diagnostiquer toujours plus vite les infections et optimiser le traitement représente un enjeu majeur tant du point de vue individuel que collectif. Pour le patient, il s’agit en effet de la condition d'une adaptation thérapeutique et donc d’une prise en charge optimale et individualisée. À l’échelle collective, c’est l’assurance de favoriser le bon usage des antibiotiques (BUA) et de freiner ainsi le développement des résistances bactériennes, véritable enjeu de santé publique du XXIème siècle. 

Par sa capacité à améliorer la rapidité et la pertinence du rendu des examens de microbiologie, mais aussi à libérer les biologistes de tâches répétitives et chronophages au profit de missions à haute valeur médicale ajoutée, l’automatisation des laboratoires s’est donc imposée au fil des ans comme un nouveau standard. Mais à ses nombreux bénéfices se sont couplés de nouveaux défis, qu’il s’agisse du pilotage des différents équipements, de la maîtrise des flux de travail, ou encore de l’exploitation et de la valorisation des multiples données recueillies. Autant de sujets que l’industriel bioMérieux n’a eu de cesse d’adresser, en proposant il y a plusieurs années déjà son middleware MYLA®, auquel succède désormais MAESTRIA™.

Faisant office de véritable tour de contrôle en interconnectant les automates de microbiologie du laboratoire, le dernier-né de la gamme logicielle de bioMérieux permet d’automatiser et de superviser de manière centralisée les différentes étapes du flux de travail, depuis l’enregistrement des échantillons jusqu’aux résultats finaux des analyses de bactériologie. MAESTRIA™ entend ainsi accompagner les laboratoires vers plus de traçabilité, la standardisation des pratiques et une optimisation des résultats.

Dès réception des échantillons, l’interface oriente les techniciens vers le flux de travail idéal et optimise les systèmes pour l’analyse microbiologique. Des résultats des hémocultures aux antibiogrammes VITEK 2 et l’interprétation des CMI (Concentration Minimale Inhibitrice), en passant par la possibilité d’intégrer une coloration GRAM ou un antibiogramme manuel, toutes les données nécessaires au biologiste sont à portée de main, de manière simple et intuitive. Le logiciel permet en outre de définir des règles d’interprétation des antibiogrammes propres à chaque laboratoire, en fusionnant les résultats de plusieurs méthodes.

« Nous souhaitons fournir aux laboratoires cliniques les outils logiciels dont ils ont besoin pour optimiser les flux de travail de test et nous cherchons également à évoluer vers une surveillance plus simple, plus rapide et plus fiable », explique ainsi Mark Miller, Directeur Exécutif des Affaires Médicales au sein de l’entreprise. Une simplicité qui se concrétise à l’usage par l’adoption d’une interface graphique innovante et une ergonomie pensée pour se rapprocher de celle d’un smartphone.

Mais l’objectif de bioMérieux ne se cantonne pas à cette gestion optimisée des examens. Le spécialiste mondial du diagnostic in vitro s’est également intéressé à l’exploitation et à la mise en valeur des différentes informations recueillies par son middleware tout au long de la chaîne de microbiologie. « Les données des laboratoires sont clés pour comprendre l’épidémiologie locale et les profils de résistances afin de favoriser le bon usage des antibiotiques. De quoi augmenter l’efficacité des actions pour mieux combattre l’antibiorésistance et améliorer les soins apportés aux patients », rappelle le Directeur Exécutif.

Divisé en cinq grandes thématiques – management général de la paillasse, hémoculture, identification des germes et antibiogrammes, antibiogramme cumulé et efficience du laboratoire de microbiologie –, le module complémentaire CLARION Lab Analytics, accessible en un clic depuis MAESTRIA™, propose donc la mise à disposition de statistiques dynamiques, sous forme de tableaux de bord actualisés en temps réel et facilement personnalisables.

Il en va ainsi du volet « Hémoculture ». En compilant les données de l’automate VIRTUO® telles que le volume d’échantillon prélevé, la positivité des résultats, ou l’horodatage des actions, associées aux données des systèmes d’identifications et d’antibiogramme, CLARION Lab Analytics est en mesure de générer l’ensemble des indicateurs de performances liés au temps et à la qualité. On notera par exemple la gestion des taux de positivité, des volumes de sang par flacons, ou le taux de contamination. Autant d’éléments impactants pour les finances des établissements. La mesure de l’efficience du laboratoire n’est pas en reste avec l’analyse des temps de réaction – acheminement et chargement des flacons, délais de prise en charge des flacons positifs –, pour un parcours biologique optimisé dans le contexte d’urgence médicale qu’est le sepsis.   

L’onglet « Antibiogramme cumulé » de CLARION Lab Analytics constitue quant à lui une source d’informations à très haute valeur médicale. Facilement exportable sous forme de rapport afin d‘être partagé avec les cliniciens, le tableau de bord dispose en effet de codes couleur selon les profils de sensibilité des organismes aux différents antibiotiques, les seuils pouvant être personnalisés en fonction des souhaits du laboratoire.

In fine, MAESTRIA™ « permet aux médecins d’avoir accès facilement et rapidement à des données utiles pour prendre des décisions vitales pour le patient », résume Mark Miller. Et plus globalement, d’accompagner les laboratoires dans une démarche d’amélioration continue.
 
> Découvrez MAESTRIA™ en détails et en vidéo.

> Article publié dans l'édition de septembre d'Hospitalia à lire ici.

Antibiorésistance, la pandémie silencieuse

Une analyse systémique publiée en janvier 2022 dans la revue The Lancet*, estimait à près de 5 millions, le nombre de décès imputables au développement de l’antibiorésistance pour la seule année 2019. Selon le rapport O’Neill, daté de 2016 et repris par l’OMS, la résistance des pathogènes aux agents antimicrobiens pourrait même devenir la première cause de mortalité au monde et causer 10 millions de morts par an d’ici à 2050.
(* Global burden of bacterial antimicrobial resistance in 2019 : a systematic analysis, The Lancet, Volume 399, Issue 10325, p.629-655, February 12, 2022)


Management de la performance du laboratoire

Au-delà du volet bactériologique, l’exploitation dynamique des données permise par le module CLARION Lab Analytics offre de véritables opportunités en matière de gestion de la performance du laboratoire. Ainsi, « Lab Manager » fournit une vue instantanée et personnalisable sur un ensemble d’indicateurs de performance clés (KPI) relatif aux équipements. Le tableau de bord « Efficience du laboratoire » propose quant à lui un suivi en temps réel de l’activité analytique des automates de microbiologie et de la performance du laboratoire en termes de délais de production d’analyses. Il est par exemple possible de détailler les temps de réalisation des différentes étapes du parcours biologique d’un patient septique ou de mesurer l’activité et le délai de réalisation de GRAM sur des cultures critiques telles que l’hémoculture.